Ein in der Schweiz einmaliges Angebot im Bereich der Archäologie ist die Verbindung von Geistes- und Naturwissenschaften in einem Haus. Neben dem kompletten Angebot in Ur- und Frühgeschichte (in Zusammenarbeit mit der Ur- und Frühgeschichtlichen und Provinzialrömischen Archäologie der Phil.-Hist. Fakultät) sind Archäobiologie und Geoarchäologie fester Bestandteil der Lehre.
Forschungsschwerpunkte der IPNA sind: